Pour optimiser la gestion administrative des ressources humaines et favoriser le développement du capital humain, les TPE et PME doivent impérativement se doter d’un logiciel RH adapté à leurs besoins. En 2025, ces outils ne se contentent plus de gérer les congés ou la paie : ils deviennent de véritables alliés stratégiques pour gagner du temps, automatiser les tâches répétitives, assurer la conformité légale et améliorer l’expérience collaborateur.
Mais face à la diversité des solutions disponibles sur le marché, comment choisir celle qui correspond le mieux à votre entreprise ? Pour vous aider, nous avons sélectionné le Top 15 des meilleurs logiciels de gestion RH pour TPE et PME en 2025. Ce comparatif vous permettra d’identifier les plateformes les plus performantes selon vos priorités : simplicité d’utilisation, fonctionnalités, évolutivité ou rapport qualité-prix.
Lucca est un logiciel RH français qui se démarque par sa modularité et sa simplicité d’utilisation. Conçu pour les entreprises de taille moyenne, il permet de digitaliser progressivement tous les processus RH grâce à une gamme d’outils spécialisés.
Lucca s’adresse aux entreprises en croissance qui veulent gagner du temps, fiabiliser leurs données RH et améliorer l’expérience collaborateur. Son interface moderne, intuitive et 100 % cloud facilite l’adoption par les équipes, même sans service RH dédié.

Des modules à la carte
- Timmi Absences
- Pagga Paie
- Cleemy Notes de frais
- Poplee Entretiens
Avantages
- Gestion des congés et absences, automatisée
- Dématérialisation des bulletins de paie
- Suivi des entretiens annuels et objectifs
Inconvénients
- Limitations de personnalisation
- Coût potentiellement élevé
Remote est une solution RH complète conçue pour simplifier la gestion des talents internationaux. Cette plateforme tout-en-un permet aux TPE-PME de recruter, onboarder et gérer des collaborateurs dans plus de 180 pays sans créer d’entité juridique locale, ni avoir à se soucier des complexités administratives.
Grâce à son expertise juridique intégrée, Remote automatise la paie, garantit la conformité légale et optimise la gestion des avantages sociaux selon les réglementations spécifiques à chaque pays. La plateforme sécurise votre expansion internationale en éliminant les risques juridiques potentiels.
Avec son interface particulièrement intuitive et son support client dédié, Remote vous libère des tâches administratives chronophages pour vous concentrer pleinement sur votre cœur de métier et le développement de votre équipe mondiale.

Ce qui distingue Remote
- 180 pays accessibles
- Solution propriétaire complète
- Expertise juridique internationale
Avantages
- Conformité légale dans + de 180 juridictions
- Gestion RH internationale simplifiée
- Expansion sans création d'entités juridiques à l'étranger
Inconvénients
- Personnalisation limitée
- Coûteux si faible effectif international
Factorial est une solution RH complète dédiée à la gestion administrative du personnel. Cette plateforme tout-en-un permet aux TPE-PME de centraliser et d’automatiser l’ensemble des processus RH : absences, temps de travail, recrutement, onboarding et évaluation des performances.
La solution digitalise intégralement le dossier administratif des employés et offre un tableau de bord personnalisable qui donne un accès en temps réel aux indicateurs clés RH. Factorial libère les équipes RH des tâches chronophages pour leur permettre de se concentrer sur le développement du capital humain et la stratégie d’entreprise.
Accessible sur tous les appareils, Factorial permet aux collaborateurs de gérer leurs demandes d’absence et de consulter leurs informations en toute autonomie, améliorant significativement l’expérience employé.

Ce qui distingue Factorial
- Interface intuitive
- Fonctions modulables
- De 10 à 1000 employés
Avantages
- Centralisation des données et processus RH
- Automatisation des tâches
- Autonomie des collaborateurs
Inconvénients
- Fonctionnalités limitées
- Personnalisation restreinte
Skello est une solution complète conçue pour simplifier la gestion des plannings et du personnel. Cette plateforme tout-en-un permet aux TPE-PME de créer, modifier et partager facilement les emplois du temps, tout en automatisant le suivi des heures et la gestion administrative.
Grâce à ses algorithmes d’optimisation, Skello suggère des plannings efficaces en tenant compte des contraintes légales, des compétences requises et des préférences des collaborateurs. La solution digitalise entièrement la gestion des temps de travail et calcule automatiquement les heures supplémentaires, les congés et les variables de paie.
Accessible depuis n’importe quel appareil, Skello permet aux employés de consulter leurs horaires, poser des congés et signaler leurs disponibilités, favorisant ainsi l’engagement et réduisant l’absentéisme.

Ce qui distingue Skello
- Intelligence prédictive
- Notifications automatiques
- Conformité légale permanente
Avantages
- Réduction du temps consacré à la planification
- Pas d'erreur de paies
- Meilleure répartition des ressources internes
Inconvénients
- Temps d’adaptation
- Coûteux pour les TPE
Cegid est une solution de gestion d’entreprise complète. Cette plateforme permet aux TPE-PME d’intégrer en un seul environnement la comptabilité, la paie, les ressources humaines, la relation client et la gestion commerciale, tout en garantissant une conformité totale avec les exigences légales françaises.
La suite Cegid s’appuie sur une expertise métier approfondie pour proposer des fonctionnalités adaptées à chaque secteur d’activité, avec des éditions spécialisées pour le retail, les professions comptables, l’hôtellerie-restauration et bien d’autres. La plateforme garantit une conformité légale permanente grâce à des mises à jour régulières intégrant les évolutions fiscales et sociales.
Disponible en cloud ou en installation locale, Cegid offre une vision à 360° de l’activité de la TPE-PME et permet une prise de décision éclairée grâce à ses outils d’analyse et de reporting personnalisables.

Ce qui distingue Cegid
- Solutions métiers spécifiques
- Écosystème complet
- Conformité réglementaire
Avantages
- Centralisation des données
- Automatisation des processus
- Outils d'analyse décisionnelle
Inconvénients
- Complexité d'implémentation
- Coût financier significatif
Flatchr est une solution complète conçue pour simplifier et accélérer le recrutement de nouveaux talents. Cet outil tout-en-un permet aux TPE-PME de gérer l’intégralité du processus de recrutement, de la diffusion des offres d’emploi jusqu’à l’inboarding des nouveaux collaborateurs.
Grâce à sa technologie intelligente, Flatchr automatise la diffusion multicanal des annonces, le tri des candidatures et la gestion des entretiens. La solution propose également des outils de promotion de la marque employeur avec des pages carrières personnalisables, des formulaires de candidature optimisés et une expérience candidat fluide.
Entièrement configurable, Flatchr s’adapte aux workflows spécifiques de chaque TPE-PME et offre une interface collaborative permettant à toutes les parties prenantes de participer efficacement au processus de recrutement.

Ce qui distingue Flatchr
- Multidiffusion intelligente
- Interface collaborative
- Outils de marque employeur
Avantages
- Sourcing et tri des CV plus rapide
- Expérience candidat et recrutements de qualité
- CVthèque intelligente
Inconvénients
- Pas de gestion RH complète
- ROI faible si peu de recrutements
Silae est une plateforme française qui permet aux TPE-PME et aux cabinets comptables de produire des bulletins de paie conformes, d’automatiser les déclarations sociales et de gérer l’ensemble des aspects administratifs de la gestion du personnel.
Grâce à son moteur de paie performant et constamment mis à jour, Silae garantit une conformité totale avec les innombrables règles sociales, conventionnelles et fiscales françaises. La solution offre également un portail salarié intuitif et des modules dédiés pour la gestion des temps, les notes de frais et les entretiens professionnels.
Particulièrement prisée des experts-comptables, Silae combine puissance fonctionnelle et modèle économique attractif avec une facturation à l’usage sans coût fixe prohibitif.

Ce qui distingue Silae
- Moteur de paie français
- Mise à jour permanente
- Fonctionnalités de production
Avantages
- Fiabilité des paies et déclarations sociales
- Gains de productivité majeurs
- Facturation au bulletin sans investissement initial
Inconvénients
- Interface utilisateur technique
- Ergonomie peu moderne
PayFit est une solution cloud conçue pour simplifier la gestion de la paie et des processus RH. Cette plateforme permet aux TPE-PME d’automatiser le traitement des bulletins de salaire, les déclarations sociales et la gestion administrative du personnel.
Grâce à sa technologie JetLang propriétaire, PayFit assure une mise à jour permanente des évolutions législatives et conventionnelles, garantissant une conformité totale avec la réglementation sociale française. La solution offre également un portail collaborateur complet permettant aux salariés de gérer leurs congés, leurs notes de frais et leurs documents administratifs en toute autonomie.
Simple d’utilisation, PayFit propose une interface moderne et intuitive qui réduit considérablement le temps consacré aux tâches administratives et limite les risques d’erreurs dans le traitement de la paie.

Ce qui distingue Payfit
- Conformité légale permanente
- Interface intuitive
- Support client réactif
Avantages
- Paies et des déclarations sociales automatisées
- Gain de temps significatif
- Réduction des risques de non-conformité
Inconvénients
- Plus limité que des SIRH
- Intégrations limitées
N2F est une solution spécialisée conçue pour simplifier la gestion des notes de frais. Cette plateforme digitale permet aux TPE-PME d’automatiser entièrement le processus de collecte, de validation et de remboursement des frais engagés par les collaborateurs.
Grâce à son application mobile performante, N2F facilite la collecte des justificatifs en déplacement et leur transformation automatique en données comptables exploitables. La solution intègre des circuits de validation personnalisables et des contrôles automatiques pour garantir le respect des politiques de dépenses de l’entreprise.
Compatible avec les principaux logiciels comptables du marché, N2F assure une intégration fluide des données de frais dans la comptabilité générale et analytique de l’entreprise.

Ce qui distingue N2F
- Reconnaissance OCR avancée
- Application mobile performante
- Intégrations ERP et logiciels
Avantages
- Traitement rapide des notes de frais
- Meilleure expérience collaborateur en mobilité
- Meilleur contrôle des dépenses professionnelles
Inconvénients
- Pas de gestion RH globale
- Personnalisation complexe
Kelio est une solution complète conçue pour optimiser la gestion des temps, des activités et de la planification. Cette plateforme modulaire permet aux TPE-PME de gérer précisément les horaires, présences, absences et activités des collaborateurs tout en garantissant une conformité totale avec la législation du travail.
Grâce à son expertise approfondie en droit social, Kelio automatise le calcul des heures supplémentaires, des repos compensateurs et autres variables complexes selon les conventions collectives applicables. La solution s’intègre harmonieusement avec la plupart des systèmes de paie pour assurer un traitement fiable des informations.
Disponible en mode SaaS ou on-premise, Kelio propose différents terminaux de pointage et applications mobiles permettant une collecte flexible des temps selon les besoins spécifiques de chaque organisation.

Ce qui distingue Kelio
- Expertise pointue en droit social
- Richesse fonctionnelle
- Évolutivité : TPE à grand groupe
Avantages
- Temps de travail et variables de paie fiables
- Planification RH optimisée
- Suivi analytique des temps par projets / activités
Inconvénients
- Longue phase de paramétrage
- Investissement initial important
Netchex est une solution RH conçue pour simplifier l’ensemble des processus liés au parcours des collaborateurs, de l’onboarding à l’offboarding. Cette plateforme permet aux TPE-PME de gérer efficacement le recrutement, l’onboarding, la paie, les avantages sociaux, la performance et le développement des talents.
Grâce à son architecture cloud native, Netchex offre une expérience utilisateur moderne et accessible depuis n’importe quel appareil. La solution se distingue par sa capacité à centraliser les données RH dans un système unique, facilitant ainsi le reporting stratégique.
Particulièrement adaptée aux entreprises internationales, Netchex assure une conformité réglementaire aux exigences fiscales et sociales des États-Unis tout en proposant un accompagnement personnalisé pour optimiser les processus RH.

Ce qui distingue Netchex
- Couverture du cycle employé
- Experts dédiés aux clients
- Outils avancés d'analyse RH
Avantages
- Simplification administrative
- Amélioration de l'expérience collaborateur
- Visibilité accrue sur les KPI RH
Inconvénients
- Adaptation requise pour l'Europe
- Prise en main complexe
Bizneo est une solution qui permet aux TPE-PME de digitaliser progressivement leurs processus RH avec des modules spécialisés pour le recrutement, l’onboarding, l’évaluation des performances, la formation et le développement des compétences.
Grâce à son approche centrée utilisateur, Bizneo offre une interface intuitive qui facilite son utilisation par toutes les parties prenantes de l’entreprise. La solution se distingue par sa flexibilité permettant d’activer uniquement les modules nécessaires et de les interconnecter pour un suivi cohérent du parcours collaborateur.
Bizneo s’adapte parfaitement aux entreprises en croissance souhaitant structurer progressivement leur fonction RH sans investissement massif initial.

Ce qui distingue Bizneo
- Implémentation progressive
- Expérience utilisateur soignée
- Rapports personnalisables
Avantages
- Digitalisation progressive
- Gestion des talents optimisée
- ROI rapide grâce à l'approche modulaire
Inconvénients
- Déséquilibre paie - talents
- Dispositions françaises à évoluer
ComboHR est une solution SIRH complète conçue pour gérer efficacement le recrutement, l’administration du personnel, la formation, les compétences et la performance des collaborateurs de la TPE-PME, dans un environnement unifié et collaboratif.
Grâce à son architecture moderne et évolutive, ComboHR s’adapte parfaitement aux spécificités de chaque organisation et à son évolution dans le temps. La solution propose une approche par workflow qui fluidifie les processus RH et automatise les tâches administratives récurrentes.
Dotée d’une interface personnalisable et d’un portail collaborateur intuitif, ComboHR favorise l’autonomie des salariés et l’engagement des managers dans les processus RH quotidiens.

Ce qui distingue ComboHR
- Adaptation aux spécificités
- Approche centrée workflows
- Déploiement rapide
Avantages
- Centralisation complète des données RH
- Digitalisation fluide des processus
- Tableaux de bord personnalisables
Inconvénients
- En constante évolution
- Requiert des intégrations tierces
Eurecia est une solution RH digitale conçue pour simplifier la gestion administrative et améliorer la qualité de vie au travail. Cette plateforme modulaire permet aux TPE-PME de gérer efficacement les congés, absences, notes de frais, entretiens professionnels et l’engagement des collaborateurs.
Grâce à son interface particulièrement intuitive et son expérience utilisateur soignée, l’outil Eurecia est vite pris en main par l’ensemble des collaborateurs. La solution met l’accent sur la digitalisation des processus RH récurrents tout en offrant des fonctionnalités innovantes de baromètre social et d’animation de la vie d’entreprise.
Accessible depuis n’importe quel appareil, Eurecia valorise l’autonomie des collaborateurs et la transparence des processus RH, contribuant ainsi à un climat social positif.

Ce qui distingue Eurecia
- Expérience collaborateur et QVT
- Baromètre social
- Reconnaissance entre pairs
Avantages
- Simplification administrative
- Souci de l'engagement collaborateurs
- Déploiement et ROI rapides
Inconvénients
- Administratif > gestion des talents
- Requiert des développements
Logitio est une solution SIRH complète et intuitive qui centralise et automatise la gestion administrative du personnel, les congés et les absences, le suivi du temps de travail et les documents RH.
Grâce à son interface épurée et son ergonomie soignée, Logitio garantit une prise en main rapide par tous les utilisateurs, qu’ils soient administrateurs RH, managers ou collaborateurs. La solution propose un portail employé moderne favorisant l’autonomie et la responsabilisation de chacun.
Entièrement personnalisable, Logitio s’adapte aux spécificités organisationnelles de chaque TPE-PME et évolue avec elle grâce à des mises à jour régulières intégrant les innovations technologiques et réglementaires.

Ce qui distingue Logitio
- Simplicité d'utilisation
- Personnalisation poussée
- Support client réactif
Avantages
- Digitalisation rapide des processus
- Gain de temps significatif
- Communication interne et transparence
Inconvénients
- Solutions enterprise + complètes
- Modules en cours d'évolution